Şeyh Zayed Camii’nin mimarisi farklı İslam Medeniyetler’inden birçok izi taşıyor. 30.000 kişiyi ağırlayabilecek kapasitede olan Merkez Avlu Pakistan’da bulunan Badshahi Camii ve Fas’ta bulunan 2. Hasan Camii’den esinlenerek tasarlanmıştır. Avlunun dört bir köşesinde 107 metre uzunluğunda Mısır, Kuzey Afrika ve Osmanlı mimarisi izlerini taşıyan minareler yer alır.